位于北门的郑氏因子孙郑用锡于1853年考取进士，并且是首位以台湾本籍考中者，称为开台进士及开台黄甲，因而大幅提升郑氏家族地位。郑氏家庙于年所建，为三开二进的单院建筑，门庭前埕的八卦铺面较为特别，屋嵴为燕尾式三川嵴式，木架比例合宜线条优美，凋刻装饰相当精美，极富有艺术价值，为台湾地区三级古迹。家庙门前有两对旗竿座，是从进士第移至此安置的，只有中试科举的人家才得以放置，不过因历史悠久现在今只剩下旗竿基座与夹杆石。郑氏家庙每年都会有两次祭祀，分别是元宵节春祭以及冬至秋祭，郑式八大房后裔均会回到家庙参与祭祀。
新竹郑氏家庙为座西北朝东南的格局，主体为三开间两进式的单院建筑，前后两进与两侧厢廊围绕“中央”天井，左右对称格局端正。建筑材料与，均选择同于家乡金门的闽南风格去建造，象征新竹郑家一脉是从金门分支而来且不忘本的精神。郑氏家庙与其右邻之吉利第、春官第以及进士第等4栋建筑物，组成了1个小型的宗族聚落。家庙因为是此聚落核心，建于该建筑群最尊贵的左侧，而且因属于祀典空间性质，家庙是唯一具有三开间格局的，屋顶为重脊式燕尾顶(屋脊弯曲且两端作成燕尾式分叉装饰)，起翘的角度与线条均十分优美；结构则采用严谨的正方形平面组织规则，整栋建筑物是由10个小正方形组合而成，反映出1种有特色的几何秩序。门庭前埕的八卦铺面，在台湾地区较为罕见，门厅门旁的镂窗及檐下的雀替、垂花，展现造时木匠工艺的精美，家庙内的石鼓、象征祥瑞的石雕动物，非一般人家得以建造，由此可以感受到当时郑家的财力。
新竹郑家重视文风，对子孙教育相当重视，致使清领时期，郑家共出过一进士、三举人，清代科举考试为举人以上之考生，可建旗杆，可以挂匾，如果是举人就挂文魁，若是进士则挂进士。郑氏家庙原该有4对旗杆，因年久失修，今现存二对，虽因风化严重，仍可见左侧雕龙右侧雕虎的石雕工艺。家庙正殿内乡贤、恩元、文魁、进士等匾额林立，再加上前埕花岗岩质的旗杆座4座，这些珍贵的历史文物，成为郑家文风鼎盛的代表象征。古代中国自古以农为本，在民间女子将会出嫁从夫，也因此在旧时有重男轻女的观念，出嫁在外的女儿是鲜少回家祭祖的，新竹郑氏家庙的祭典除了官式仪式特色外，另有2特点，其一每年祭典时，欢迎出嫁女儿全家大小一同回家祭祖，为台湾民间习俗中较为少见，其二家庙为当时八大房所创建，但祭典不局限于此八大房参与，举凡为郑氏任一分支子孙，都欢迎返乡参与祭祖，正因为如此，在2010年春祭祭典时，创下近500人与会，活动后席开46桌的惊人纪录，更透过这样的祭典，让分散在各地的郑氏后裔，联系情感、宣扬祭祖传统不忘本的精神。
