百年来的台大医院，从蒋渭水、杜聪明到李镇源等，均在台湾政治社会变迁的时代洪流中扮演了颇具分量的社会良心角色，也许是时代需求不同，这几年的台大医院院长似乎愈来愈不像一号人物，尤其现任院长陈明丰在这次破天荒的器官移植疏失中，人间蒸发了四天才向社会淡淡说声抱歉，相较于主动请辞的移植小组召集人柯文哲成了英雄人物，陈明丰的表现让不少台大内外人士大感失望。当然，连台大校长李嗣涔的开学致词都出现希望学生不要翘课这类琐事，治校成就也以募款规模让人印象深刻，也许就不必强求他所指定的台大医院院长能超越前人了。
汇聚了全台湾最多的第一名学生，投注了全台湾最大的公众资源，承受了全台湾最高的社会期待，台大医院在一百多年来一直是台湾人的骄傲，但近年竟然连连爆发重大疏失，让病人受到伤害，让台湾在国际上蒙羞！许多人不忍在这些事件中苛责辛苦的医疗团队，然而，从整体面来检视台大医院近年的发展，却令人不得不指出：台大医院生了重病！位居医界龙头，作为台湾医疗的最后一道防线，台大医院是否让人看到高傲、看不到反省？是否在健保体制下随波逐流，没有立定方向？台大医院的这场病，同时也反映了台湾医界的危机，需要台大本身及台湾社会痛定思痛，用最高标准好好为它诊断、治疗。希望台大医院早日康复！
台大医院新大楼门厅右手边，原本有一面伦理墙，是由前医学院长、肝病权威陈定信书写一篇〈我们的信念〉作为台大医师誓词；今年起，这面墙被换上宣导医病人员勤洗手的卫教海报。讽刺的是，八月中旬，台大医院还刚在庆贺拿到亚太手部卫生优良奖已开发台湾地区组第一名，但到了八月下旬，台大医院竟爆发误将爱滋器官移植给五名病患（一名在成大医院）的全球医学史上大灾难！回想起两年半前，台大医院也发生台湾医学史上首度的手术室失火、导致一名患者死亡。不禁令人纳闷：台大医院第一名的光环褪色了吗？这家台湾龙头医疗及医学重镇，到底出现了什么危机？冰冻三尺，非一日之寒，其实，台大医院危机与警讯早就浮现，一个明显指标就是被荣总夺回御医地位。台大医院在第一个台湾人台湾地区领导人李登辉时期囊括台湾地区领导人、副台湾地区领导人医疗团队召集重任，一改两蒋时代独厚荣总的传统。然而，二○○○年李登辉卸任台湾地区领导人后到台大医院安装心脏支架，事后却爆发他说台大医院差点害死我的风波，隔年李改赴日本就医，○三年起更以到荣总看病为主。知情医师透露，当年李登辉请来日本名医光藤与台大医院合作，却因台大心脏科的派系心结，竟发生两路人马抢着帮老李动手术的状况，才让李登辉气得开骂。另一个关键事件则发生在副台湾地区领导人萧万长身上，○九年马萧就职周年隔天，萧万长到荣总进行肺腺癌切除手术，使得由肠胃科教授王正一召集的台大副台湾地区领导人医疗团队脸上无光。知情人士指出，台大医院之所以未能及时从老萧的健检报告中发现癌症，同样是源自山头主义的心结，应该能够看出问题的人，那时并没有看到萧的检验报告。其实，这两个漏气事件，以及开刀房失火、爱滋器官移植风暴，都不是因为台大医院的医术出了问题，那么台大是哪里出了问题？台大的问题，是否也有部分反映了台湾医界的共同问题？问题一：权力斗争领导弱化两年前鸿海集团郭台铭宣布捐赠台大一五○亿元兴建癌医中心、资助生医研究，时任台大医院院长的林芳郁却是在签约仪式当天上午才接获台大校方通知。事实上，台大医院院长竟是由校长指派，与成大医院是由各科部主任选出两名院长候选人，再由校长和医学院长勾选的方式不同。这样的权力结构下，促使台大医院曾集结势力大反扑。十八年前台大医院强力动员推出首位医生校长陈维昭，当年身在台大的感染科权威、前疾管局长苏益仁认为，那正是台大医院的转捩点。校长选举变成权力运作，弱化了台大的学术高度；当时医学院长在外开业的争议，也弱化了台大的道德高度。他说，当台大热中于权力、许多优秀医师出走时，正好李远哲回台接掌中研院，加上后来台湾地区卫生研究院成立，使得台大在医学研究领域独大的地位出现板块挪移。而这场选举，也主导了台大医院近二十年的派系发展
陈明丰当上院长被视为派系的产物，虽然派系斗争绝非台大医院独有，但多年来院内教授角逐台大医院院长、医学院院长的结果，常常是成者为王、败者变成流寇出走，优秀人才难以和谐相处，对台大的竞争力伤害不小。问题二：企管导向利弊互见台大医院每年预算规模逾两百亿元，其中来自补助的教学研究经费却只有八亿元，自负盈亏的压力让台大医院近年吹起企管风，讲究成本效益、绩效管理，让研究单位屡屡感受到被高层批评没产值的压力。ＭＢＡ化是目前台大医院最大的危机，一位青壮辈的台大主治医师表示，九八年上任的院长李源德开始强化各种管理模式，现任院长陈明丰则是受李鼓励去念ＥＭＢＡ的大弟子，李源德一开始做很有效，因为之前台大太散漫了，但现在管理层动不动搬出ＭＢＡ术语，用生存、现代化当理由，用奖励金制度鼓励我们去做获利较高的医疗行为。
