位于花瓶石旁，依山坡而建，是一间佛、道合一也是岛上建筑最雄伟、最新的庙宇，交通船驶入小琉球时映入眼帘的就是灵山寺；由此地遥望台湾本岛，即可看见大武山、凤山及万寿山，每到傍晚多数游客、居民常聚集于庙前广场观赏夜景。
交通：
(1)北及中南部游客，可经由省道１号高速公路南下，由小港机场出口沿省道１７号公路，往东港行驶即可抵达东港码头，在码头搭船往小琉球，至岛上再租机车环岛。
(2)东部游客，可经由省道９号公路，往枫港方向接省道１号公路，往枋寮、林边到东港码头，在码头搭船往小琉球，至岛上再租机车环岛。
