碧云寺位于本屿大寮庄山顶，即上福村与大福村之间，恰当琉球屿之中心，主奉观世音菩萨，小琉球居民无论婚丧喜庆、求姻缘、问生病、求渔船满载等等，必前来求签请示，是乡民最重要的精神信仰。
碧云寺位于琉球屿的中心，兴建于1736年，至今已有200多年历史，主祀观音菩萨。乡民无论婚嫁择日，吉凶卜卦等事，均前来请求观音佛祖指引，是全乡的信仰中心。
1980年，已故蒋经国先生因视察乡政抵达琉球乡，曾亲临此庙，并捐献香油钱一千元，而让该寺声名远播。
碧云寺下方设有步道可观赏竹林生态湿地，漫步其间，阳光自树缝间洒落，一片清爽，夜晚点点灯光投射下，片片竹林伴随潺潺流水，随风摇曳作响，蛙鸣声此起彼落。
在清朝雍正年间（公元一七二三～一七三五年），有一位籍叫田深氏者，自打狗迁移至本屿杉板路居住（为今上福村田氏祖先），那时他在今碧云寺前园宅内构建一座小茅舍从事牧羊。有一夜，他梦见南海普陀山观音佛祖要他在此地建立庙寺，田氏惊醒，感念佛祖的灵显，于是遍告岛民，共同计划将他的土地损献出来建庙，就在乾隆元年（公元一七三六年）建立一座草庙名为「观音亭」。并雕刻佛像，永为敬拜，据说乡民求卜都很灵验，因此香火鼎盛。
碧云寺交通：
(1)北及中南部游客，可经由省道１号高速公路南下，由小港机场出口沿省道１７号公路，往东港行驶即可抵达东港码头，在码头搭船往小琉球，至岛上再租机车环岛。
(2)东部游客，可经由省道９号公路，往枫港方向接省道１号公路，往枋寮、林边到东港码头，在码头搭船往小琉球，至岛上再租机车环岛。
