开基灵佑宫建於1665年，主祀玄天上帝，庙内有一尊全台唯一的金面玄天上帝神像，因为建庙时期最早，所以有着开基之名，但因规模与民权路的北极殿相比较小，所以也有着小上帝庙之称，因历史悠久几经改建及二战损坏，现今庙宇的座向曾在日治时期改变，其改变座向的痕迹现今仍保留现地展示。
与祭祀玄天上帝的庙宇相同，因玄天上帝代表北方之神，北方属水，水属黑，灵佑宫内就采用大量的黑柱红梁，此外，庙宇内彩绘石雕有不少府城名师的作品，正殿内的「三十六官将」壁画就是蔡草如的作品，其余还有名师潘岳雄及陈寿彝的作品在灵佑宫内，都非常珍贵。
另外较为人所熟知的还有许丙丁所着的台语神怪小说「小封神」就是由开基灵佑宫为故事的主轴，是一座传奇色彩浓厚的庙宇。
开基灵祐宫位于当时府城镇北坊赤嵌街后开基灵祐宫（今台南市民族路二段巷号），建于明永历年，为当时的驻军与居民合力兴建此庙。列为三级古迹。开基灵祐宫俗称小上帝庙，以别于惯称大上帝庙的北极殿。一座两殿两廊式的建筑，中门前有一对抱鼓石，凋花鸟图桉，根茎叶脉线条鲜明，刀法柔腻。台湾时间年，日据时明治公学校扩充校舍，将正殿反向迁移于三川门前，而成坐东朝西的方位。庙曾将腐朽的屋顶、樑桁等抽换修整或上新彩，直到台湾时间年，才重建成今日的规模，整座庙宇因而失去典雅的古意。
地址：民族路二段二0八巷三一号
