阿里山高山博物馆，位于阿里山森林游乐区内，在阿里山宾馆的西南方。阿里山原本是一整片的原始森林，面积多达三万余公倾。整个山区遍及热、暖、温、寒四带，拥有丰富傲人的树种，也因此，日本人便在台湾时间元年，于此地设立高山植物博物馆，珍藏这些宝贵的天然资源，一直到台湾省林务局接收后，才重新整理、规划其展示内容。
现在的阿里山高山博物馆是一栋木造的红色建筑，收藏了阿里山早期开垦时所使用的器械用具，像是开发初期的集材机模型、阿里山森林游乐区规画模型、早期美、英、日所生产的横切锯…等等。里面还有一座迷你型的吴凤庙，旁边搭建了许多原住民的住屋、集会所、仓库等精致的模型，并展出许多日常生活用具，如弓、枪、烟斗、春米木杵、口琴…等等，甚至还看得到古早以前的老式电话。
除了这些原住民的服饰和生活器具之外，馆内还陈列着台湾的野山羊、野猪、水鹿、云豹、山猫等高山动物的剥制标本及生态背景，以及各种鸟类、蛇类、两栖类的浸液标本。其他像是蝴蝶、昆虫和高山鼠类、蝙辐等标本，以及阿里山各种高山植物的蜡叶标本也很丰富。除此之外，阿里山的地质、土壤、树种等标本、模型和图表也都很齐全，像是阿里山五种主要的树种：铁杉、红桧、台湾扁柏、台湾肖楠、峦大杉，在这里都看得到，而阿里山铁路沿线的土壤种类、阿里山出土的岩石和化石如海胆、双壳贝…等，也是一应俱全。
地址：位于阿里山森林游乐区内，阿里山宾馆西南方。
交通：
至阿里山森林游乐区：
1.在嘉义火车站搭乘嘉义县营公车，阿里山线，至终点站下车即可。
2.在“国光”客运台北车站搭乘“国光”号至阿里山。
3.搭乘阿里山森林小火车，至阿里山站下车即可。(停驶中)
注：大众交通工具班次较少，出发前建议先详查发车时间。
